民國52年8月14日蔣中正總統主持中國國民黨第8屆中常會第463次會議，鑑於54年11月12日為國父百年誕辰紀念，除應舉行隆重慶典儀式外，尤須著重擘建一個能夠深入人心、流傳永久之設施，方足以表揚國父偉大人格、革命行誼與思想學，始能感奮當代，啟發來茲。爰決定成立「紀念 國父百年誕辰籌備小組」，主持籌劃工作。

嗣經「籌備小組」商定紀念事項5項，其首項為「建築紀念館，須兼備文化教育活動用途，並整理有關資料，留作永久史蹟」，提報民國52年9月21日中國國民黨第8屆中常會第472次會議通過。

民國53年9月1日「中華民國各界紀念國父百年誕辰籌委會」正式成立，決定：「建築紀念館因須兼備文化教育活動，以發揚青年對於 國父之景慕起見，建築規模，宜宏大耐久，地點應在台北市，用途以一部份作為青年活動文化中心，一部份陳列有關史蹟，並規劃四周為公園。成立紀念館建築委員會專責辦理」。

民國54年11月12日蔣總統主持奠基典禮，黨政軍首長暨各國專程前來參加國父百年誕辰慶典之外賓、僑團及國內各界領導人士千餘人，均參加盛典。

民國55年元月由全國各界組成「國父紀念館興建委員會」接辦興建工作，公開徵求建築圖樣，經初複選後，以王大閎建築師所設計之圖樣獲選，並遵照蔣總統指示：「應在外型方面加強中國建築之特色」，修正設計，複製模型，奉蔣總統於民國56年8月10日批示：「贊成」。

本館於民國57年3月12日正式開工，民國61年5月16日主要工程完成，舉行落成典禮，由「國父紀念館興建委員會」主任委員王雲五先生向政府呈現，並由當時副總統兼行政院院長嚴家淦先生代表接受。