高雄市立歷史博物館為城市觀光重要的一環，也是民眾終身學習的重要場域，本館及附屬館舍本於深耕高雄，存續文化知識、展現地方視野的營運理念，致力於高雄歷史深入研究、豐實各類館藏主題，策辦多元精彩的在地性展覽、建立本館成為高雄地區文史知識庫，更期待跨越海洋，走向國際，加強文化交流。

1992年（民國81年）1月18日，市政府搬遷至苓雅區「合署辦公大樓」，舊市府建築完成階段性任務，功成身退。因其歷史地位意義重大，緊繫高雄市發展脈絡，市政府特於原址重新規劃設立「高雄市立歷史博物館」，藉以保存發揚高雄地區歷史文化，並於1998年（民國87年）10月25日正式開館，成為台灣第一座由地方政府經營的歷史博物館。

2017年（民國106年）高雄市立歷史博物館走出公部門暨傳統博物館框架，改制為全台第一個由地方政府成立之行政法人的博物館舍之一，結合公私部門資源，擴大能量，積極展現多元社會議題，並持續承擔為市民記憶城市成長的重要使命，共同見證城市發展的軌跡。